История
Институт был создан в 1970 году в связи с введением в МАИ новой специальности «Прикладная математика». Первоначальное название — факультет «Прикладной математики и физики». В состав факультета были включены кафедры высшей математики, прикладной и вычислительной математики, физики, химии, которые ранее входили в состав факультета общетехнических кафедр института. На факультет были возложены следующие задачи: обеспечение учебного процесса по математике, физике и химии для всех специальностей института, организация учебного процесса и выпуск специалистов по специальности «Прикладная математика».
В феврале 1973 года факультет был переименован и получил название «Прикладная математика», в его состав была включена кафедра теоретической механики, а кафедра химии была переведена на факультет общеинженерной подготовки. На базе кафедр высшей и прикладной математики были созданы четыре кафедры: алгебры и теории функций; теории вероятностей и математической статистики; дифференциальных уравнений и математической теории управления; вычислительной математики и программирования.
В 1993 году факультету возвращено первоначальное название «Прикладная математика и физика».
В 2017 году факультет получил новое название «Информационные технологии и прикладная математика».
В 2019 году факультет был преобразован в институт.
В 2022 году часть кафедр (общеобразовательный цикл) была переведена в структуру института «Общеинженерная подготовка», а институт № 8 получил новое название — «Компьютерные науки и прикладная математика», которое является его современным названием.
В 2025 году в институте прошла реорганизация кафедрального блока и были созданы научный и образовательный центр, в котором в рамках реализации федерального проекта «Кадры для цифровой трансформации» национального проекта «Экономика данных и цифровая трансформация государства» был создан Центр образовательных программ топ-уровня в сфере информационных технологий.
Институт гордится тем, что среди преподавателей института были: лауреат Ленинской и Государственных премий СССР, заслуженный деятель науки и техники РСФСР, академик РАН В. С. Пугачёв; члены-корреспонденты РАН К. А. Абгарян, В. Г. Веретенников, У. Г. Пирумов; лауреаты Государственной премии СССР, профессора Н. Б. Варгафтик, В. В. Семёнов. Большой творческий вклад в развитие факультета внесли его деканы: К. А. Абгарян, В. Г. Веретенников, В. Н. Серёгин, П. С. Красильников. Работу института в настоящее время возглавляет директор института доцент С. С. Крылов.